北交所的交易方式主要包含竞价交易、大宗交易、盘后固定价格交易，同时配套做市商机制以及协议转让等特殊转让模式，不同交易方式面向不同资金体量、交易场景的投资者，普通二级市场散户主要参与竞价交易，大额资金、机构投资者会更多运用大宗交易、盘后固定价格交易完成筹码流转，协议转让则多用于股权收购、战略入股这类特殊场景。很多习惯币圈合约、场外撮合交易的用户，在转向北交所投资时，容易混淆各类交易模式的适用边界，分清不同交易方式的规则，能够避免委托失败、交易条件误判等实际问题。
竞价交易是北交所最基础、使用频率最高的交易方式，分为集合竞价与连续竞价两个子模式，遵循价格优先、时间优先的撮合原则。集合竞价分为开盘集合竞价和收盘集合竞价，开盘集合竞价时段为9点15分到9点25分，其中9点20分到9点25分阶段不支持撤单，收盘集合竞价在14点57分到15点，该时段仅可提交限价申报，无法使用市价单。9点30至11点30、13点至14点57分属于连续竞价，投资者既可以下限价单，也可以提交市价申报，未成交的申报订单会自动延续到后续竞价阶段继续参与撮合。同时竞价交易可以叠加做市商机制，由合规机构持续提供双向买卖报价，改善部分流动性偏弱个股的盘口深度，这点和加密市场做市商提供流动性的逻辑有相似之处，但整体受严格监管约束。
大宗交易主要服务大额筹码交易，门槛为单笔申报数量不低于10万股或者交易金额不少于100万元，满足任一条件即可发起大宗委托。申报时间覆盖交易日9点15分到11点30分、13点到15点30分，不过实际成交确认固定在15点至15点30分，不会干扰盘中竞价的股价走势。对于机构、大户来说，通过大宗交易完成大额买卖，能够避免在盘中直接砸盘或者扫货造成股价剧烈波动，类似币圈的大额场外撮合，不过北交所大宗交易依旧在交易所系统内完成，成交价格需要在当日涨跌幅限制区间之内，成交记录也会对外公示，不存在完全脱离监管的私下成交。
盘后固定价格交易是收盘之后的补充交易渠道，交易撮合时间为15点05分到15点30分，申报可以在交易日白天交易时段提交，全部订单统一以当日股票收盘价作为唯一成交价，再按照时间优先的规则逐笔匹配成交。需要注意买入申报限价不能低于收盘价，卖出申报限价不能高于收盘价，不符合条件的委托会直接判定无效，当日处于停牌状态的股票无法参与盘后固定价格交易。这种模式适合不想参与盘中博弈，希望直接以收盘价格完成建仓或者离场的投资者，不会对盘中价格产生扰动，也给中长期资金增加了一个稳定的进场出口。
协议转让属于特殊的交易途径，并不面向普通日常买卖，主要应用在上市公司收购、重大股份权益变动、引入战略投资者等场景，不能用于普通投资者日常短线买卖。该模式需要单独向北交所提交申请，经过审核之后才能够执行，和币圈自由的场外转账转让完全不一样，有着严格的适用范围与审批流程，普通散户基本不会接触到这一转让渠道。北交所整套交易体系兼顾普通散户的小额交易与机构大额流转需求，不同交易方式各司其职，投资者需要结合自身资金规模、交易目的，选择适配的委托渠道，不要混淆各类模式的门槛与时间规则，防止委托无法正常成交。
