新三板并不在上交所、深交所交易，其股票交易场所为全国中小企业股份转让系统，运营主体是全国中小企业股份转让系统有限责任公司，很多投资者容易将新三板与北京证券交易所相互混淆，二者属于两套独立运营的市场平台，不能混为一谈。不少刚接触一级市场、股权投融资的币圈交易者，习惯把所有股权交易板块统称为交易所，进而产生认知误区，认为新三板归属沪深交易所，理清交易场所归属，是参与新三板股权交易、区分股权与加密资产投资风险的基础前提。
全国中小企业股份转让系统是经国务院批准设立的全国性证券交易场所，也是国内首家采用公司制运营模式的证券交易场所，2013年正式揭牌运营。从资本市场层级划分来看，它和上海证券交易所、深圳证券交易所属于平行的全国性证券交易场所，不存在隶属关系。新三板市场内部划分基础层与创新层，挂牌企业大多为创新型、成长型中小微企业，挂牌不等于上市，挂牌公司属于非上市公众公司，这也是它和沪深交易所上市公司最核心的区别。投资者想要参与新三板交易，需要单独开通对应交易权限，满足资产与投资经验门槛，无法直接使用普通A股账户进行交易。
很多市场参与者容易混淆新三板与北交所的关联，这里需要明确，北京证券交易所虽然由全国股转公司统筹管理，但属于独立的证券交易所。北交所上市公司来源于新三板创新层满足条件的挂牌企业，企业完成北交所上市后，股票交易场所就从全国中小企业股份转让系统切换至北交所，不再属于新三板交易范畴。简单来说，新三板是企业进入北交所的重要培育平台，二者相互衔接，但交易系统、交易规则、监管细则相互独立，挂牌企业和上市公司适用两套不同制度，投资者在研究标的时，需要区分标的究竟是新三板挂牌企业，还是北交所上市企业。
对于长期关注币圈、股权赛道的投资者而言，理清新三板交易场所归属还有一层现实意义。加密资产市场不存在正规证券交易场所，而新三板属于国内持牌合规股权交易市场，两者监管框架、资产属性完全不同，不能套用加密市场的交易逻辑参与新三板投资。新三板采用协议转让、做市转让、集合竞价等多元化交易方式，流动性整体弱于交易所上市股票，价格波动规则、转让限制、信息披露要求都具备独特性，盲目参考加密币种交易思路很容易放大投资风险。同时新三板股权交易受到证监会严格监管，所有交易行为都需要通过持牌券商完成，不存在场外私下撮合的合规通道。
